Zakon jezuitów, to zakon kaznodziejów, którzy słowem nawracają wątpiących. Największym z nich jest bez wątpienia Piotr Skarga, słynny ze swoich 'Kazań Sejmowych'. Po śmierci, jeszcze przed zakończeniem budowy świątyni, został on pochowany w jedej z krypt, dzisiaj krypta ta udostępniona jest zwiedzającym. Sami krakowianie zaś składają do Boga, właśnie za pośrednictwem Kaznodziei, liczne prośby i podziękowania.
  Piotr Skarga umiera w roku 1612. W czterechsetlecie śmierci powstaje tzw. Nowa Krypta Zasłużonych. Wejście do Krypty zdobi napis:

  Panteon Narodowy
  Powstał staraniem fundacji 'Panteon Narodowy' powołanej 13 maja 2010 przez wszystkie publiczne uczelnie Krakowa, Polską Akademię Umiejętności oraz Archidiecezję Krakowską dla kontynuacji idei Grobu Zasłużonych na Skałce oraz nekropolii królewskiej na Wawelu.
  To miejsce spoczynku najwybitniejszych twórców narodowej sztuki, kultury i nauki, każdego, kto godzien jest miana Wielkiego Polaka niezależnie od poglądów i przekonań.
  Panteon Narodowy to szczególny pomnik narodowej kultury i pamięci.

  Obok Piotra Skargi spoczywają więc w Panteonie:

  • biskup Andrzej Trzebicki, dobrodziej kościoła;

  • Witold Szeliga Bieliński, młody, dwudziestoletni chłopak, który został pochowany u jezuitów na prośbę rodziców;

 
  • Sławomir Mrożek;







  • Adam Zagajewski - poeta;

 
  • Krzysztof Penderecki - kompozytor, dyrygent. Urodził się w 1933 w Dębicy. Studiował w Państwowej Wyższej Szkole Muzycznej w Krakowie (dziś Akademia Muzyczna). Słuchający nie zawsze zrozumieją jego muzykę, jest to muzyka kakafoniczna, trudna w odbiorze, wręcz psychodeliczna. I właśnie to sprawiło zapewne, że kompozycje Pendereckiego wykorzystane zostały do równie psychodelicznych filmów jak: Lśnienie Stanleya Kubricka, Dzikość serca Davida Lyncha, Wyspa tajemnic Martina Scorseze. Po śmierci kompzytora władze Akademi Muzycznej nadały szkole jego imię.




  • Karol Olszewski i Zygmunt Wróblewski - naukowcy, którzy jako pierwsi na świecie skroplili powietrze.