La iglesia bajo la advocación de San Andrés es una de más antiguas en Polonia y unica que se conservaba en tan buen estado. La iglesia se edificó por iniciativa del principe Ladislao Herman entre los ańos 1079-1098 (el mismo que construió segunda catedral en la Colina Wawel). Probablemente era primera iglesia parroquial de Cracovia. Desde su principio la iglesia tenia funcion defensivo. Los muros tienen 1,5 m de espesor. Segun un cronicle Jan Długosz, los Cracovianos salvaron en la iglesia durante invasion de Tartaros en 1241.
  En 1316 las Clarisas se establecerón aquí y viven hasta hoy en monasterio detras de la iglesia. Las Clarisas pasaon a Cracovia al cabo de invasion de los Tartaros.
  Por fin del siglo XVI la iglesia recibió nueva forma barroca. Los torres romanicos recibierón noevas copulas. El interior era tallado por Baltazar Fontana (estucos), Karol Dankwart (policromia), Francisco Placidi (altar principal y púlpito). La policromia presenta Juicio Final (en copula), Coronación de Santa Maria Virgen (abside), gloria de Santa Clara, Santa Kunegunda y beata Salome (presbiterio). El púlpito tiene su forma unica, es tallado como el barco.
  En el tesoro se conservan relicarios medievales, como un mosaico de Maria Virgen y las figuras de belén, mas antiguas en Europa.